2020年12月28日，为弘扬抗疫精神，并使之转化为全面建设社会主义现代化国家、实现中华民族伟大复兴、推进“双一流”建设的强大力量，北京大学隆重召开抗击新冠肺炎疫情表彰大会，对抗击疫情工作中表现突出的先进集体和先进个人进行表彰。经学校评审，js3845金沙线路被评为“抗击新冠肺炎疫情先进集体”，陆剑、唐小鹿被评为“抗击新冠肺炎疫情标兵”，邓宏魁、许海芬、肖俊宇、张克嘉、张璐瑶、林芳芳、卓婉清、韩启飞、谢夏青等9人被评为“抗击新冠肺炎疫情先进个人”。

自新冠疫情爆发以来，学院立即进入战时状态，第一时间由吴虹院长和刘德英书记牵头成立疫情防控小组，全员动员，严格落实各项防疫规定，摸排1800多名师生员工情况，并于疫情后期安排师生有序返校。在此期间，学院坚持停课不停教，迅速将本科生和研究生培养环节转为线上教学，本科教学评估得分为理学部第一名。学院坚持停课不停研，为维持科研基本需求制定了闭环式学生入校方案，被学工部作为先进经验分享给多个院系参考。学院制定的《楼宇物业人员疫情防控管理办法》被房产部作为范本发给各院系参考。学院多个研究组还利用自身科研优势和特长，主动承担国家疫情应急科研项目，在病毒谱系、中和抗体和抗病毒药物等方面取得了重要科学发现，得到国家有关部门的认可和嘉奖。

此外，党组织关系挂靠js3845金沙线路党委的几家教学科研单位也在抗疫工作中取得佳绩，分子医学研究所刘颖、何滨，生物医学前沿创新中心曹云龙，现代农学院黄季焜等四人被评为“抗击新冠肺炎疫情先进个人”。